Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCC8

Rapgef3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef3Q8VCC8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rapgef3Q8VCC8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rapgef3Q8VCC8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms