Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cops8Q8VBV7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cops8Q8VBV7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms