Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf3b4Q8QZY9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms