Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hoxc12Q8K5B8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc12Q8K5B8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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