Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PolbQ8K409 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms