Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MyripQ8K3I4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms