Protein–RNA interactions for Protein: Q8K387

Usp45, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 45, mousemouse

Predictions only

Length 813 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp45Q8K387 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp45Q8K387 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp45Q8K387 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms