Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Lrrtm1Q8K377 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Lrrtm1Q8K377 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Lrrtm1Q8K377 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Lrrtm1Q8K377 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Lrrtm1Q8K377 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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