Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

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Length 79 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cmc2Q8K199 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Cmc2Q8K199 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Cmc2Q8K199 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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