Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CopaQ8CIE6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CopaQ8CIE6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms