Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGK6

Ifnl3, Interferon lambda-3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnl3Q8CGK6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifnl3Q8CGK6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ifnl3Q8CGK6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms