Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcerg1Q8CGF7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcerg1Q8CGF7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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