Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp27Q8CEG8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Usp27Q8CEG8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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