Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDT7

Cabcoco1, Ciliary-associated calcium-binding coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabcoco1Q8CDT7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Cabcoco1Q8CDT7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cabcoco1Q8CDT7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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