Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Atad2Q8CDM1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Atad2Q8CDM1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms