Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc87Q8CDL9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms