Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lrrn3Q8CBC6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Lrrn3Q8CBC6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms