Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6K9

Col6a6, Collagen alpha-6(VI) chain, mousemouse

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Length 2,265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a6Q8C6K9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Col6a6Q8C6K9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Col6a6Q8C6K9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Col6a6Q8C6K9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Col6a6Q8C6K9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Col6a6Q8C6K9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col6a6Q8C6K9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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