Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E1

Apol7c, Apolipoprotein L 7c, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7cQ8C6E1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Apol7cQ8C6E1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms