Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm11541Q8C4D8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms