Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gga3Q8BMI3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gga3Q8BMI3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms