Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prpf18Q8BM39 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms