Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rspo4Q8BJ73 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms