Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmco3Q8BH01 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms