Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ubash3bQ8BGG7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ubash3bQ8BGG7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms