Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc50Q810U5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc50Q810U5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms