Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp8Q80YR6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms