Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y20

Alkbh8, Alkylated DNA repair protein alkB homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh8Q80Y20 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Alkbh8Q80Y20 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms