Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Thnsl2Q80W22 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms