Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pja2Q80U04 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pja2Q80U04 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms