Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ube2q1Q7TSS2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ube2q1Q7TSS2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms