Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ctdp1Q7TSG2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms