Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU7

Letm2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letm2Q7TNU7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Letm2Q7TNU7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.6 ms