Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK1

Rfx4, Transcription factor RFX4, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx4Q7TNK1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rfx4Q7TNK1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rfx4Q7TNK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms