Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rnf139Q7TMV1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms