Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Atp8b3Q6UQ17 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Atp8b3Q6UQ17 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atp8b3Q6UQ17 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atp8b3Q6UQ17 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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Atp8b3Q6UQ17 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b3Q6UQ17 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms