Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gja6Q6S5G4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gja6Q6S5G4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms