Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nudcd1Q6PIP5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nudcd1Q6PIP5 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms