Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sarm1Q6PDS3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms