Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mfsd13aQ6PDE8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms