Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atl2Q6PA06 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Atl2Q6PA06 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms