Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Smchd1Q6P5D8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Smchd1Q6P5D8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms