Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpbp1l1Q6NZP2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms