Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fndc3bQ6NWW9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms