Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdcd11Q6NS46 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdcd11Q6NS46 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms