Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp7Q6A4J8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp7Q6A4J8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms