Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vat1Q62465 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vat1Q62465 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms