Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

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Length 3,357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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VcanQ62059 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcanQ62059 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VcanQ62059 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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VcanQ62059 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VcanQ62059 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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VcanQ62059 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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