Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cacna1eQ61290 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms