Protein–RNA interactions for Protein: Q61088

Fzd4, Frizzled-4, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd4Q61088 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fzd4Q61088 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fzd4Q61088 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms